这篇nature造假迹象十分明显,外网科研界都在讨论。按其RNA合成法无法得到足够环用于动物实验,而且合成制备的数据完全没有。
灌像molecular cancer这种水刊或者nature子刊也许还行,但发在nature上是要接受全世界科学家评判的,我认为撤稿只是个时间问题。
没事的时候,来给大家扒一扒。
Pubpeer有讲解了,不过吃瓜群众得有点RNA biology基础知识才行,我来做下翻译。
首先,本文的图6是能够被推到自然(nature)最重要的图,其体外合成环状RNA制成疫苗在小鼠身上疗效极佳。作者利用T4 RNA连接酶1使线性RNA环化,并且添加与RNA两端接口完全互补且无空位(gap)的DNA作为夹板(splint)来提高环化效率。
这一多余的操作明显暴露出没做过实验的破绽。T4 RNA连接酶1可催化单链RNA连接反应,RNA - DNA形成的杂合双链会直接阻碍T4酶对底物的识别,环化必然被抑制,这是RNA生物学家的常识,真让人疑惑作者们是如何制备毫克级别的疫苗原料的。
为助大家理解Pubpeer质疑此文环状RNA合成方法的原因,找了一张图。
其次,在环化RNA之前得先合成线性RNA,会用到体外转录(IVT)法。本文是利用T7 RNA聚合酶来合成RNA的,该酶会结合DNA模板上的T7启动子序列从而开始转录。T7聚合酶更倾向于以GG开头的序列,这样合成出来的RNA的5‘端就是以GG起始。本文没有给出体外转录的DNA模板序列,不过给出了DNA连接物(splint)的序列以及名为Fam53B的环状RNA的接口序列。由于接口就是转录起始点,可推测其在连接物(splint)的正中央,那么转录起始就会是AAAA,这又与常识相悖。真是不好评价,只能祝他们成功了。
综合前面两点,pubpeer提出疑问:作者是怎样在体外制备环状RNA的?要是根本没有环状RNA,那些精彩的动物实验是怎么开展的?
要是没有图6,这篇文章就是个俗套的Molecular Cancer故事集,顶多蹭蹭nature子刊的热度,根本上不了Nature这种大台面。可能读者不太明白啥叫俗,到底是哪种俗?看下图就知道了。

故事线基本相同,但有肿瘤免疫和mRNA疫苗这两大热点助力,取个有高度的标题,是不是就脱颖而出了?就像鞋拔子变成如意一样!要是上述内源翻译的环状RNA都能像本文这样用T4 RNA连接酶1 + 无间隙DNA夹板制成疫苗,那人类恐怕已经对癌症免疫了。而且这些都是中国的文章,中国在这方面处于领先地位,欧美只能望尘莫及。
大家或许会疑惑,如此明显、会被人笑话的漏洞,自然(nature)的主编和同行评议是怎么通过的?公开的同行评议专家有两个美国团队,从事肿瘤和病理研究,几乎没涉足过环状RNA,所以只关注动物实验,缺乏RNA技术知识也情有可原。还有那些未公开的评议者(reviewer)肯定是做环状RNA研究的,可能找了中国人,大概是怕丢脸才匿名。要是找个欧洲的权威人士,在这种情况下根本不可能让文章通过。估计编辑也找了个中国人,安排评议者时专门避开做基础研究的,只找做临床的,这样有共同话题,能站在同一战线,便于蒙混过关。
期待后续进展,撤稿耗时,且看他们如何周旋。